Team:Duke/Notebook

From 2014.igem.org

(Difference between revisions)
Line 17: Line 17:
<td>
<td>
<div class="rightnb">
<div class="rightnb">
 +
 +
<div class="day">
<a id="apr7"><h2> April 7 </h2></a>
<a id="apr7"><h2> April 7 </h2></a>
-
Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Nam malesuada tristique bibendum. Fusce at mattis risus. Praesent porta porta mattis. Nulla id metus vitae erat mollis porttitor. Aliquam erat volutpat. Nulla gravida molestie est in pellentesque. Mauris egestas, urna eget laoreet ullamcorper, turpis enim pretium lectus, eu lobortis diam tortor sit amet ante. Aenean lacinia at libero eu tincidunt. Duis elit massa, mattis quis tempus vel, tempor ac nulla. Nam ut lectus elementum, aliquam magna varius, luctus libero. Ut non odio tincidunt, venenatis nisi sed, tempor arcu. Donec congue rutrum dolor eu fringilla. Vestibulum vel fringilla ipsum, in fringilla magna. Vivamus tristique mi dolor, a auctor eros scelerisque quis. Duis imperdiet magna augue, non ullamcorper diam condimentum laoreet. Phasellus vitae diam odio.
+
Objective: Create Z4EV-dCas9-Mxi1 construct
 +
Matthew Farnitano and Matthew Faw
 +
PCR of Z4EV from pMN10
 +
new oligos SpeI-Z4EV5p and NcoI-spc-Z4EV3p
 +
Diluted to 100uM
 +
4 tubes with 0, 0.3, 0.6, 1 uL template
 +
iGEM 3-step protocol with 65C anneal, 20 sec extend
 +
Note: did not dilute template beforehand (do this in future)
 +
Results (04/08/2014): Lanes 2 and 3 produced band at ~0.7-0.8 kb (agarose gel)
 +
Expected band size 715 bp
 +
Control (no template) showed no band, lane 4 produced faint band
 +
Lanes 3 and 4 showed strong band at ~5-6 kb (template expected 5.1 kb)
 +
Next steps:
 +
Run on gel to confirm (4/8)
 +
digest PCR product and dCas9/Mxi1 with SpeI/NcoI to ligate (4/8)
 +
</div>
 +
 
<a id="apr8"> April 8 </a>
<a id="apr8"> April 8 </a>

Revision as of 16:56, 28 July 2014


April 7

Objective: Create Z4EV-dCas9-Mxi1 construct Matthew Farnitano and Matthew Faw PCR of Z4EV from pMN10 new oligos SpeI-Z4EV5p and NcoI-spc-Z4EV3p Diluted to 100uM 4 tubes with 0, 0.3, 0.6, 1 uL template iGEM 3-step protocol with 65C anneal, 20 sec extend Note: did not dilute template beforehand (do this in future) Results (04/08/2014): Lanes 2 and 3 produced band at ~0.7-0.8 kb (agarose gel) Expected band size 715 bp Control (no template) showed no band, lane 4 produced faint band Lanes 3 and 4 showed strong band at ~5-6 kb (template expected 5.1 kb) Next steps: Run on gel to confirm (4/8) digest PCR product and dCas9/Mxi1 with SpeI/NcoI to ligate (4/8)
April 8 Ut aliquet nunc urna, bibendum lobortis erat iaculis vitae. Etiam nisl nisi, ullamcorper eget felis et, scelerisque pulvinar massa. Suspendisse hendrerit nec nisi ac blandit. Donec euismod a neque a hendrerit. Phasellus venenatis laoreet ipsum sed pellentesque. Maecenas aliquet orci vel metus viverra, ac fermentum sapien elementum. Nulla pharetra aliquam gravida. Vivamus vitae feugiat mi. Morbi ac felis ut ante mattis tempor. Morbi fermentum vitae metus sit amet luctus. Fusce nibh turpis, adipiscing quis urna vel, porta mattis felis. Pellentesque lacinia tempor pellentesque. April 10 Aliquam vestibulum ornare mauris, tincidunt rhoncus orci euismod a. Maecenas mollis felis et leo varius, at blandit turpis auctor. Nam at dictum quam, sit amet vehicula ligula. Nullam faucibus neque ac libero tempor malesuada. Quisque semper turpis luctus odio condimentum rutrum. Cras sodales ultrices condimentum. Aliquam ultrices risus at diam pretium, quis bibendum lacus elementum. Duis tincidunt nunc nunc, vitae sodales orci luctus eget. Proin ante enim, facilisis vel sapien nec, dapibus suscipit sapien. Mauris aliquet sodales lobortis. In tempus neque magna, consectetur mollis turpis laoreet dignissim. Vivamus a dui turpis. Nullam libero arcu, vestibulum sed tellus ac, ornare semper elit. Quisque facilisis egestas cursus. Curabitur fermentum leo ut odio dignissim euismod. Integer pellentesque vestibulum neque, sit amet malesuada nunc sollicitudin vel. Curabitur a dui cursus libero cursus sodales nec lobortis leo. Nulla tempor volutpat eros, id tristique felis pellentesque nec. Etiam ultrices ligula ut eros viverra, eu pharetra lacus volutpat. Aliquam mattis lobortis leo, sed ornare lacus. Mauris vel gravida velit. Quisque ut viverra nisl, eget consectetur enim. In commodo imperdiet euismod. In rhoncus a enim ut sollicitudin. Praesent mattis dolor a erat euismod interdum. In a neque non enim sollicitudin fringilla quis sit amet justo. Nam mauris massa, tristique sit amet semper sit amet, pharetra eget felis. Sed in tortor purus. Donec elit nunc, commodo vel mollis in, iaculis id nunc. Praesent ut convallis dui, a bibendum dui. Donec non malesuada quam. Duis sem urna, tincidunt sit amet odio sed, gravida tincidunt enim. Cras risus elit, laoreet vitae feugiat non, viverra vel eros. Suspendisse potenti. Maecenas vel suscipit eros.

Retrieved from "http://2014.igem.org/Team:Duke/Notebook"