Team:Imperial/Parts

From 2014.igem.org

(Difference between revisions)
 
(31 intermediate revisions not shown)
Line 7: Line 7:
                 <div class="pure-u-1-1 main">
                 <div class="pure-u-1-1 main">
-
                     <h1>Team Velociraptor</h1>
+
                     <h1>Parts</h1>
                     <div id="navWrap">
                     <div id="navWrap">
                         <div id="subNav">
                         <div id="subNav">
                             <ul>
                             <ul>
-
                                 <li><a href="#featured" class="smoothScroll">Featured Parts</a>
+
                                 <li><a data-scroll href="#featured">Featured Parts</a>
                                 </li>
                                 </li>
-
                                 <li><a href="#table" class="smoothScroll">Table of Parts</a>
+
                                 <li><a data-scroll href="#table">Table of Parts</a>
                                 </li>
                                 </li>
Line 20: Line 20:
                         </div>
                         </div>
                     </div>
                     </div>
-
                    <section id="overview">
+
                 
-
                        <div class="pure-g">
+
-
                            <div class="pure-u-1-2">
+
-
                                <h2>Overview</h2>
+
-
                                <p>(INSERT BRIEF OVERVIEW HERE)</p>
+
-
                            </div>
+
-
                            <div class="pure-u-1-3">
+
-
                                <h2>Key Achievements </h2>
+
-
                                <ul>
+
-
                                    <li></li>
+
-
                                    <li></li>
+
-
                                    <li></li>
+
-
                                    <li></li>
+
-
 
+
-
 
+
-
 
+
-
                                </ul>
+
-
                            </div>
+
-
 
+
-
 
+
-
                        </div>
+
-
 
+
-
                    </section>
+
                     <section id="featured">
                     <section id="featured">
                         <h2>Featured Parts</h2>
                         <h2>Featured Parts</h2>
-
                         <div class="accordion">
+
                         <div>
-
                             <h3>LB Featured Part 1</h3>
+
                             <h3><a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K1321340">BBa_K1321340</a></h3>
                             <div>
                             <div>
                                 <div class="pure-g">
                                 <div class="pure-g">
                                     <div class="pure-u-1-3">
                                     <div class="pure-u-1-3">
-
                                         <p>Part name/ID</p>
+
                                         <p>N-terminal linker + double CBD</p>
                                     </div>
                                     </div>
                                     <div class="pure-u-2-3">
                                     <div class="pure-u-2-3">
-
                                         <p>Part description</p>
+
                                         <p>Double cellulose binding domain (dCBD) using two cellulose binding domains from <i>Trichoderma reesei</i> cellobiohydrolases, with an N-terminal linker and internal linker sequence between the two domains which are derived from the endogenous cellobiohydrolase linker sequence. This part is in RFC(25) Freiberg fusion format to allow for easy use in protein fusions. dCBD binding affinity for cellulose was <a href="https://2014.igem.org/Team:Imperial/Functionalisation"> characterised </a> using sfGFP fusions.
 +
</p>
                                     </div>
                                     </div>
                                 </div>
                                 </div>
Line 59: Line 38:
                             </div>
                             </div>
-
                         <h3>LB Featured Part 2</h3>
+
                         <h3><a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K1321339">BBa_K1321339</a></h3>
                             <div>
                             <div>
                                 <div class="pure-g">
                                 <div class="pure-g">
                                     <div class="pure-u-1-3">
                                     <div class="pure-u-1-3">
-
                                         <p>Part name/ID</p>
+
                                         <p>CBDcenA + Linker</p>
                                     </div>
                                     </div>
                                     <div class="pure-u-2-3">
                                     <div class="pure-u-2-3">
-
                                         <p>Part description</p>
+
                                         <p>Cellulose binding domain (CBD) of Endoglucanase A (cenA) from <i>Cellulomonas fimi</i> with an endogenous C-terminal linker. The part is in Freiburg format (RFC 25) for ease of use in protein fusions.</p>
                                     </div>
                                     </div>
                                 </div>
                                 </div>
Line 72: Line 51:
                             </div>
                             </div>
-
                             <h3>LB Featured Part 3</h3>
+
                             <h3><a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K1321014"> BBa_K1321014</a></h3>
                             <div>
                             <div>
                                 <div class="pure-g">
                                 <div class="pure-g">
                                     <div class="pure-u-1-3">
                                     <div class="pure-u-1-3">
-
                                         <p>Part name/ID</p>
+
                                         <p>CBDcipA with N and C-terminal linker </p>
                                     </div>
                                     </div>
                                     <div class="pure-u-2-3">
                                     <div class="pure-u-2-3">
-
                                         <p>Part description</p>
+
                                         <p>This CBD is from the Cellulosomal -scaffolding protein A (cipA) of <i>Clostridium thermocellum </i> including the endogenous linker sequences at the N and C-terminus. It is in RFC25 format to allow for easy use in protein fusions. At present the cloning for these constructs is still in progress to correct an illegal EcoRI site which was identified in the parts with this CBD. This can be achieved with a silent mutation via site-directed mutagenesis and we aim to send these parts to the registry once this is complete.
 +
</p>
                                     </div>
                                     </div>
                                 </div>
                                 </div>
Line 85: Line 65:
                             </div>
                             </div>
-
                             <h3>LB Featured Part 4</h3>
+
                             <h3><a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K1321005">BBa_K1321005</a></h3>
                             <div>
                             <div>
                                 <div class="pure-g">
                                 <div class="pure-g">
                                     <div class="pure-u-1-3">
                                     <div class="pure-u-1-3">
-
                                         <p>Part name/ID</p>
+
                                         <p>Synthetic Phytochelatin (PC) EC20</p>
                                     </div>
                                     </div>
                                     <div class="pure-u-2-3">
                                     <div class="pure-u-2-3">
-
                                         <p>Part description</p>
+
                                         <p>A general heavy metal-binding peptide consisting of 20 Glu-Cys (EC) repeats in Freiburg format (RFC[25]) to allow for easy use in fusion proteins. We created a library of CBD fusions with this part.
 +
</p>
 +
                                    </div>
 +
                                </div>
 +
                                </div>
 +
                                <h3><a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K1321200">BBa_K1321200</a></h3>
 +
                                <div>
 +
                                <div class="pure-g">
 +
                                    <div class="pure-u-1-3">
 +
                                        <p><i>Vitreoscilla</i> haemoglobin (VHb)</p>
 +
                                    </div>
 +
                                    <div class="pure-u-2-3">
 +
                                        <p>This part is a haemoglobin isolated from <i>Vitreoscilla</i> (VHb) which improves the metabolic function of obligate aerobes and facultative anaerobes in low-oxygen conditions. We used this part in <i> G. xylinus </i> to try and improve growth rate and cellulose production.
 +
</p>
                                     </div>
                                     </div>
                                 </div>
                                 </div>
-
 
                             </div>
                             </div>
 +
                            <h3><a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K1321300">BBa_K1321300</a>, <a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K1321301">BBa_K1321301</a> </h3>
 +
                            <div>
 +
                                <div class="pure-g">
 +
                                    <div class="pure-u-1-3">
 +
                                        <p>pSEVA331 and pSEVA321 backbones</p>
 +
                                    </div>
 +
                                    <div class="pure-u-2-3">
 +
                                        <p>These are two broad host range vector backbones for which we have demonstrated use in <i>E. coli</i> and <i>Gluconacetobacter xylinus </i>.
 +
</p>
 +
                                    </div>
 +
                                </div>                           
 +
                            </div>
 +
                            <h3><a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K1321334"> BBa_K1321334</a>, <a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K1321335">BBa_K1321335</a></h3>
 +
                            <div>
 +
                                <div class="pure-g">
 +
                                    <div class="pure-u-1-3">
 +
                                        <p>Cellulose synthase operon AcsAB and AcsCD</p>
 +
                                    </div>
 +
                                    <div class="pure-u-2-3">
 +
                                        <p>Designed and refactored from <i>G. xylinus</i>, this operon was inserted into <i>E.coli </i> for cellulose synthesis.
 +
</p>
 +
                                    </div>
 +
                                </div>
 +
 +
</div>
 +
                            <h3><a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K1321305">BBa_K1321305</a>,<a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K1321306"> BBa_K1321306</a></h3>
 +
                            <div>
 +
                                <div class="pure-g">
 +
                                    <div class="pure-u-1-3">
 +
                                        <p><i>Gluconacetobacter xylinus</i> strains ATCC53582 and Kombucha Isolate</p>
 +
                                    </div>
 +
                                    <div class="pure-u-2-3">
 +
                                        <p>We created and characterised a library of parts for this organism, with the aim to increase the accessibility the chassis for future work in iGEM. By sharing these strains and their genomes on the registry we hope this will contribute to their ease of use and characterisation.
 +
</p>
 +
                                    </div>
 +
                                </div>         
 +
                        </div>
                 </div>
                 </div>
Line 103: Line 132:
                 <section id="table">
                 <section id="table">
                     <h2>Table of Parts</h2>
                     <h2>Table of Parts</h2>
-
                     <div class="content  content-info">
+
                      
-
                         <groupparts>iGEM014 iGEM14_Imperial</groupparts>
+
                          
Line 127: Line 156:
     </div>
     </div>
</html>
</html>
 +
<groupparts>iGEM014 Imperial</groupparts>
 +
 +
{{:Team:Imperial/Templates:footer}}
{{:Team:Imperial/Templates:footer}}

Latest revision as of 03:59, 18 October 2014

Imperial iGEM 2014

Aqualose

Parts

Table of Parts

<groupparts>iGEM014 Imperial</groupparts>


Retrieved from "http://2014.igem.org/Team:Imperial/Parts"