Team:UFMG Brazil

From 2014.igem.org

(Difference between revisions)
 
(5 intermediate revisions not shown)
Line 1: Line 1:
{{UFMG_Brazil/css}}
{{UFMG_Brazil/css}}
 +
{{Danzi_Kesh_8_css}}
<html class=" desktop landscape" lang="en">
<html class=" desktop landscape" lang="en">
Line 54: Line 55:
                                         <li><a href="https://2014.igem.org/Team:UFMG Brazil/Project/Intro">Introduction</a></li>
                                         <li><a href="https://2014.igem.org/Team:UFMG Brazil/Project/Intro">Introduction</a></li>
                                         <li><a href="https://2014.igem.org/Team:UFMG_Brazil/Project/Parts">Parts</a></li>
                                         <li><a href="https://2014.igem.org/Team:UFMG_Brazil/Project/Parts">Parts</a></li>
-
                                         <li><a href="https://2014.igem.org/Team:UFMG_Brazil/Project/Protocols">Protocols</a></li>
+
                                         <li><a href="https://2014.igem.org/Team:UFMG_Brazil/Project/Protocols">Protocols and results</a></li>
                                         <li><a href="https://2014.igem.org/Team:UFMG_Brazil/Project/Modelling">Modelling</a></li>
                                         <li><a href="https://2014.igem.org/Team:UFMG_Brazil/Project/Modelling">Modelling</a></li>
-
                                         <li><a href="#">Policy and practices</a></li>
+
                                         <li><a href="https://2014.igem.org/Team:UFMG_Brazil/Project/Policy">Policy and practices</a></li>
-
                                         <li><a href="#">Notebook</a></li>
+
                                         <li><a href="https://2014.igem.org/Team:UFMG_Brazil/Project/Notebook">Notebook</a></li>
                                     </ul>
                                     </ul>
                                 </li>
                                 </li>
-
                                 <li><a href="#">Acknowledgements</a>
+
                                 <li><a href="#">Thanks to</a>
                                     <ul style="display:none;">
                                     <ul style="display:none;">
                                       <li>
                                       <li>
Line 66: Line 67:
                                       </li>
                                       </li>
                                       <li>
                                       <li>
-
                                         <a href="https://2014.igem.org/Team:UFMG_Brazil/sponsors">Attributions</a>
+
                                         <a href="https://2014.igem.org/Team:UFMG_Brazil/attributions">Attributions</a>
                                       </li>
                                       </li>
                                     </ul>
                                     </ul>
Line 125: Line 126:
   =========================================================-->
   =========================================================-->
-
  <!--
 
     <div id="content">
     <div id="content">
Line 131: Line 131:
             <div class="container">
             <div class="container">
                 <div class="row">
                 <div class="row">
-
                     <div class="grid_4 wrap">
+
                     <div class="grid_2 wrap"></div>
 +
                    <div class="grid_8 wrap">
                         <div class="thumbnail">
                         <div class="thumbnail">
-
                             <h3>Powerball <br>$173.0 <span>Million</span></h3>
+
                             <h3>So, how to stop a war before it started?</h3>
-
                             <p>Cash Option: $102.0 <span>Million</span>
+
                             <br>
-
                             </p>
+
                             <p style="text-transform: none;"><span>Colorectal cancer includes tumors affecting a segment of the large intestine (colon) and rectum. It is treatable and, in most cases, curable when detected early, before it hasn't spread to other organs. <br><br>However, the diagnosis requires a biopsy, made ​​by handset introduced via rectum. Noticeably, this procedure is highly invasive and often inhibits patients to submit to this practice, hampering the discovery of cancer at an early stage and thereby reducing the chances of effective treatment and cure. On our institution, a modified probiotic strain of Saccharomyces cerevisiae was isolated from local beverage.<br><br>Our objective is to introduce this strain as a new probiotic chassis on iGEM, and also to develop a gene circuit that allows it to detect one or more stool biomarkers for colorectal cancer on the intestine and report with a color change on the feces. We chose L-DNA (long DNA molecules) as biomarker, and designed a chimeric protein using TALE DNA-Binding Domains and a split version of mCherry.<br><br> This protein can detect certain repetitive sequences on DNA and emit red fluorescence, which when measured serve as proxy for the DNA size. Since RFP emission falls on the visible spectrum, it can also be used for staining the feces, allowing for a patient consuming the probiotic to become aware of the possibility of the developing problem just by checking on the color of their stool.</span></p>
-
                            <p>NEXT DRAW: <span>MAY 31</span>
+
-
                            </p>
+
-
                            <ul class="list">
+
-
                                <li>19</li>
+
-
                                <li>24</li>
+
-
                                <li>45</li>
+
-
                                <li>18</li>
+
-
                                <li>36</li>
+
-
                                <li>5</li>
+
-
                            </ul>
+
-
                        </div>
+
-
                    </div>
+
-
                    <div class="grid_4 wrap">
+
-
                        <div class="thumbnail">
+
-
                            <h3>Mega Millions<br>$26.0 <span>Million</span></h3>
+
-
                            <p>Cash Option: $102.0 <span>Million</span>
+
-
                            </p>
+
-
                            <p>NEXT DRAW: <span>MAY 31</span>
+
-
                            </p>
+
-
                            <ul class="list">
+
-
                                <li>19</li>
+
-
                                <li>24</li>
+
-
                                <li>45</li>
+
-
                                <li>18</li>
+
-
                                <li>36</li>
+
-
                                <li>5</li>
+
-
                            </ul>
+
-
                        </div>
+
-
                    </div>
+
-
                    <div class="grid_4">
+
-
                        <div class="thumbnail">
+
-
                            <h3>Lotto <br>$3.9 <span>Million</span></h3>
+
-
                            <p>Cash Option: $102.0 <span>Million</span>
+
-
                            </p>
+
-
                            <p>NEXT DRAW: <span>MAY 31</span>
+
-
                            </p>
+
-
                            <ul class="list">
+
-
                                <li>19</li>
+
-
                                <li>24</li>
+
-
                                <li>45</li>
+
-
                                <li>18</li>
+
-
                                <li>36</li>
+
-
                                <li>5</li>
+
-
                            </ul>
+
                         </div>
                         </div>
                     </div>
                     </div>
Line 186: Line 143:
         </div>
         </div>
 +
<!--
         <div class="bg3">
         <div class="bg3">
             <div class="container">
             <div class="container">
Line 216: Line 174:
             </div>
             </div>
         </div>
         </div>
 +
      -->
-
 
+
        <!--
         <div class="bg4 p47">
         <div class="bg4 p47">
Line 291: Line 250:
         </div>
         </div>
-
 
+
  -->
-
 
+
         <div class="bg4 p35">
         <div class="bg4 p35">
             <div class="container">
             <div class="container">
                 <div class="row">
                 <div class="row">
-
                     <div class="grid_3 wrap">
+
                     <div class="grid_12 wrap">
-
                         <h4>I`m a</h4>
+
                         <h4>We are from Brazil!</h4>
-
                        <ul class="list1">
+
                         <p>aaa aaa</p>
-
                            <li><a href="#">Player</a>
+
-
                            </li>
+
-
                            <li><a href="#">Winner! Now what?</a>
+
-
                            </li>
+
-
                            <li><a href="#">Retailer or Want to Be One</a>
+
-
                            </li>
+
-
                            <li><a href="#">Journalist</a>
+
-
                            </li>
+
-
                            <li><a href="#">Job Seeker</a>
+
-
                            </li>
+
-
                            <li><a href="#">Vendor or Want to Be One</a>
+
-
                            </li>
+
-
                        </ul>
+
-
                    </div>
+
-
                    <div class="grid_3 wrap">
+
-
                        <h4>Help me</h4>
+
-
                         <ul class="list1">
+
-
                            <li><a href="#">Find More Ways to Buy</a>
+
-
                            </li>
+
-
                            <li><a href="#">Pick A Game</a>
+
-
                            </li>
+
-
                            <li><a href="#">Play Responsibly</a>
+
-
                            </li>
+
-
                            <li><a href="#">Contact the Lottery</a>
+
-
                            </li>
+
-
                            <li><a href="#">See Supported Browsers</a>
+
-
                            </li>
+
-
                            <li><a href="#">View the Site Better</a>
+
-
                            </li>
+
-
                        </ul>
+
-
                    </div>
+
-
                    <div class="grid_3 wrap">
+
-
                        <h4>Show me</h4>
+
-
                        <ul class="list1">
+
-
                            <li><a href="#">Winning Numbers</a>
+
-
                            </li>
+
-
                            <li><a href="#">Scratchers Games End </a>
+
-
                            </li>
+
-
                            <li><a href="#">How To Claim Prizes</a>
+
-
                            </li>
+
-
                            <li><a href="#">Recent Winners</a>
+
-
                            </li>
+
-
                            <li><a href="#">Odds Of Winning</a>
+
-
                            </li>
+
-
                            <li><a href="#">Where the Money Goes</a>
+
-
                            </li>
+
-
                            <li><a href="#">What’s New on the Website</a>
+
-
                            </li>
+
-
                        </ul>
+
-
                    </div>
+
-
                    <div class="grid_3">
+
-
                        <h4>Connect with us</h4>
+
-
                        <ul class="list1 asd">
+
-
                            <li><a href="#"><i class="fa fa-twitter"></i>twitter</a>
+
-
                            </li>
+
-
                            <li><a href="#"><i class="fa fa-facebook"></i>facebook</a>
+
-
                            </li>
+
-
                            <li><a href="#"><i class="fa fa-linkedin"></i>linkedin</a>
+
-
                            </li>
+
-
                        </ul>
+
                     </div>
                     </div>
                 </div>
                 </div>
Line 365: Line 263:
         </div>
         </div>
     </div>
     </div>
-
  -->
 
     <!--========================================================
     <!--========================================================

Latest revision as of 17:44, 14 June 2015

Home UFMG Team

So, how to stop a war before it started?


Colorectal cancer includes tumors affecting a segment of the large intestine (colon) and rectum. It is treatable and, in most cases, curable when detected early, before it hasn't spread to other organs.

However, the diagnosis requires a biopsy, made ​​by handset introduced via rectum. Noticeably, this procedure is highly invasive and often inhibits patients to submit to this practice, hampering the discovery of cancer at an early stage and thereby reducing the chances of effective treatment and cure. On our institution, a modified probiotic strain of Saccharomyces cerevisiae was isolated from local beverage.

Our objective is to introduce this strain as a new probiotic chassis on iGEM, and also to develop a gene circuit that allows it to detect one or more stool biomarkers for colorectal cancer on the intestine and report with a color change on the feces. We chose L-DNA (long DNA molecules) as biomarker, and designed a chimeric protein using TALE DNA-Binding Domains and a split version of mCherry.

This protein can detect certain repetitive sequences on DNA and emit red fluorescence, which when measured serve as proxy for the DNA size. Since RFP emission falls on the visible spectrum, it can also be used for staining the feces, allowing for a patient consuming the probiotic to become aware of the possibility of the developing problem just by checking on the color of their stool.

We are from Brazil!

aaa aaa

Retrieved from "http://2014.igem.org/Team:UFMG_Brazil"