Team:NCTU Formosa/Notebook/test6

From 2014.igem.org

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-
2
+
<p>
 +
 
 +
2014/9/9(二)
 +
Cultivation of:     
 +
Pcons+RBS+SacI PCR product-16 Ar
 +
Pcons+RBS+SaII  PCR product-17 Ar
 +
RBS+BFP+Ter  PCR product-16,17,29,30 Ar
 +
Digestion of:
 +
XhoI+PSB1K3 (EP)
 +
</p><p>
 +
2014/9/10(三)
 +
Mini prep of:
 +
                  RBS+BFP+Ter-16 Ar
 +
                  RBS+BFP+Ter-17 Ar
 +
                  RBS+BFP+Ter-29 Ar
 +
                  RBS+BFP+Ter-30 Ar
 +
                  Pcons+RBS+Sac-16 Ar
 +
                  Pcons+RBS+Sal-17 Ar
 +
Digestion of:
 +
                  RBS+BFP+Ter-16 Ar(EP)
 +
                  RBS+BFP+Ter-17 Ar(EP)
 +
                  RBS+BFP+Ter-29 Ar(EP)
 +
                  RBS+BFP+Ter-30 Ar(EP)
 +
                  Pcons+RBS+SacI-16 Ar(EP)
 +
                  Pcons+RBS+SalI-17 Ar(EP)
 +
Electrophoresis:
 +
                  Well1:Marker
 +
                  Well2:Pcons+RBS+SacI-16 dig(EP)
 +
                  Well3:Pcons+RBS+SalI-17 dig(EP)
 +
                  Well4:RBS+BFP+Ter-16 dig(EP)
 +
                  Well5:RBS+BFP+Ter-17 dig(EP)
 +
                  Well6:RBS+BFP+Ter-29 dig(EP)
 +
                  Well7:RBS+BFP+Ter-30 dig(EP)
 +
                  Well8:XhoI-7 dig(XP) Kr
 +
</p><p>
 +
2014/9/11(四)
 +
Digestion of:
 +
                  Pcons+RBS+PBAN(ES)(8種除了XhoI)
 +
                  RBS+BFP+Ter(XP)
 +
Ligation of:
 +
Pcons+RBS+XhoI-7 Ar
 +
Cultivation of:
 +
                  Pcons+RBS+AseI-7 Ar
 +
                  Pcons+RBS+SacI-16 Ar
 +
                  Pcons+RBS+SalI-17 Ar
 +
                  Pcons+RBS+NcoI-2 Ar
 +
                  Pcons+RBS+NdeI-2 Ar
 +
                  RBS+BFP+Ter-2 Ar
 +
                  RBS+BFP+Ter-2 Ar
 +
                  SalI-3 Kr
 +
 
 +
Ligation of:
 +
                  Pcons+RBS+XhoI-7 Ar
 +
 
 +
DNA sequencing of:
 +
                  Pcons+RBS+SaeI Ar 8ul VF2
 +
                  Pcons+RBS+SalI Ar  8ul VF2
 +
                  RBS+BFP+Ter-29 Ar 8ul VF2 + 8ul VR
 +
                  RBS+BFP+Ter-30 Ar 5ul VF2 + 5ul VR
 +
Digestion of:
 +
                  Pcons+RBS+HindIII dig(EP)
 +
                  Pcons+RBS+NheI dig(EP)
 +
                  Pcons+RBS+NcoI dig(EP)-->9/11養的mini
 +
                  Pcons+RBS+NdeI dig(EP)
 +
                  Pcons+RBS+SacI dig(EP)
 +
                  Pcons+RBS+SalI dig(EP)
 +
                  Pcons+RBS+AseI dig(EP)
 +
                  Pcons+RBS+KpnI dig(EP)
 +
Ligation of:
 +
                  Pcons+RBS+BFP+Ter-30 Kr
 +
</p><p>
 +
 
 +
 
 +
2014/9/12(五)
 +
Transformation of:
 +
                  Pcons+RBS+NheI+RBS+BFP+Ter Kr
 +
                  Pcons+RBS+NdeI+RBS+BFP+Ter Kr
 +
                  Pcons+RBS+HindIII+RBS+BFP+Ter Kr
 +
                  Pcons+RBS+KpnI-HF+RBS+BFP+Ter Kr
 +
                  Pcons+RBS+AseI+RBS+BFP+Ter Kr
 +
Pcons+RBS+SacI+RBS+BFP+Ter Kr
 +
                  Pcons+RBS+NcoI+RBS+BFP+Ter Kr
 +
                  Pcons+RBS+SalI+RBS+BFP+Ter Kr
 +
                  Pcons+RBS+BFP+Ter Kr
 +
                  Pcons+RBS+XhoI Ar
 +
Electrophoresis:
 +
                  Well1:Marker
 +
                  Well2:Pcons+RBS+NdeI dig(EP) Cr
 +
                  Well3:Pcons+RBS+NcoI dig(EP) Cr
 +
                  Well4:Pcons+RBS+SacI dig(EP) Ar
 +
                  Well5:Pcons+RBS+SalI dig(EP) Ar
 +
                  Well6:Pcons+RBS+AseI dig(EP) Ar
 +
                  Well7:Pcons+RBS+HindIII dig(EP) Ar
 +
                  Well8:Pcons+RBS+NheI dig(EP) Ar
 +
                  Well9:Pcons+RBS+KpnI dig(EP) Ar
 +
</p>
 +
<p>
 +
2014/9/13(六)
 +
Ligation of:
 +
                  Pcons+RBS+AseI Kr
 +
                  Pcons+RBS+NdeI Kr
 +
                  Pcons+RBS+SalI Kr
 +
                  Pcons+RBS+SacI Kr
 +
PCR of:
 +
                  Pcons+RBS+HindIII+RBS+BFP+Ter Kr x8
 +
                  Pcons+RBS+NheI+RBS+BFP+Ter Kr x8
 +
Pcons+RBS+NdeI+RBS+BFP+Ter Kr x8
 +
                  Pcons+RBS+NcoI+RBS+BFP+Ter Kr x8
 +
                  Pcons+RBS+KpnI-HF+RBS+BFP+Ter Kr x8
 +
                  Pcons+RBS+AseI+RBS+BFP+Ter Kr x8
 +
                  Pcons+RBS+Xhol Kr x8
 +
                  Pcons+RBS+SalI+RBS+BFP+Ter Kr x16
 +
                  Pcons+RBS+SacI+RBS+BFP+Ter Kr x16
 +
Electrophoresis:
 +
                  Gel 1
 +
                  Pcons+RBS+SalI+RBS+BFP+Ter Kr x16
 +
                  Gel 2
 +
                  Pcons+RBS+SacI+RBS+BFP+Ter Kr x16
 +
                  Gel 3
 +
                  Pcons+RBS+HindIII+RBS+BFP+Ter Kr x8
 +
                  Pcons+RBS+NheI+RBS+BFP+Ter Kr x8
 +
                  Gel 4
 +
                  Pcons+RBS+NdeI+RBS+BFP+Ter Kr x8
 +
                  Pcons+RBS+NcoI+RBS+BFP+Ter Kr x8
 +
                  Gel 5
 +
                  Pcons+RBS+KpnI-HF+RBS+BFP+Ter Kr x8
 +
                  Pcons+RBS+AseI+RBS+BFP+Ter Kr x8
 +
                  Gel 6
 +
                  Pcons+RBS+Xhol Kr x8
 +
                  psb1K3 dig(EP)
 +
</p>
 +
 
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Revision as of 14:20, 10 October 2014

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2014/9/4(四) Cultivation of: Pcons+RBS+AseI PCR product-1,2,3,4,7,8 Ar XhoI+PSB1K3 PCR product-1,2 Kr PSB1A3 Ar Cultivation plate test: Ar plate and Kr plate Digestion of: [PBAN-HindIII] Kr*2 (EP), [PBAN-NheI]Kr*2 (EP), [PBAN-KpnI-HF]Kr*2 (EP) 23101+B0034+PBAN (HindIII)]Ar(ES),[23101+B0034+PBAN (NheI)]Ar(ES) PCR of: [J23101+B0034+KpnI-HF] Ar*3 Ligation of: [J23101+B0034+KpnI-HF+PSB1C3] Electrophoresis of: [PBAN-HindIII] Kr*2 (EP), [PBAN-NheI]Kr*2 (EP), [PBAN-KpnI-HF]Kr*2 (EP),[23101+B0034+PBAN (HindIII)]Ar(ES),[23101+B0034+PBAN (NheI)]Ar(ES),[23101+B0034+PBAN (HindIII)]Ar(EP)*2,[23101+B0034+PBAN (NheI)]Ar(EP),[23101+B0034+PBAN (KpnI-HF)]Ar(EP)*2,[23101+B0034+PBAN (KpnI-HF)]Ar PCR*3.

2014/9/5(五) Electrophoresis: Well 1 Pcons+RBS+AseI--1 (EP) Ar Well 2 Pcons+RBS+AseI--2 (EP) Ar Well 3 Pcons+RBS+AseI--3 (EP) Ar Well 4 Pcons+RBS+AseI--4 (EP) Ar Well 5 Pcons+RBS+AseI--7 (EP) Ar (DNA sequencing) Well 6 Pcons+RBS+AseI--8 (EP) Ar Well 7 Pcons+RBS+NcoI--2 (EP) Cr (DNA sequencing) Well 8 Pcons+RBS+Ndel--2 (EP) Cr (DNA sequencing) Well 9 1 Kb marker Well 10 Pcons+RBS+Ndel--13 (EP) Cr Well 11 SacI--3 (XP) Kr Well 12 SacI--4.1 (XP) Kr Well 13 SacI--4.2 (XP) Kr Well 14 XhoI--7 (EP) Kr (DNA sequencing) Well 15 XhoI--8 (EP) Kr(DNA sequencing) Well 16 SalI--3 (XP) Kr Mini prep of: Pcons+RBS+KpnI-HF-7 Pcons+RBS+KpnI-HF-8 Pcons+RBS+KpnI-HF-9 Digestion of: Pcons+RBS+KpnI-HF-7 (EP) Pcons+RBS+KpnI-HF-8 (EP) Pcons+RBS+KpnI-HF-9 (EP) Cultivation of: Pcons+RBS+KpnI-HF Ar PCR product-7,8,9 Ar Ligation of: [J23101+B0034+HindIII+B0034+PSB1K3] Kr [J23101+B0034+HindIII+J61048+PSB1K3] Kr [J23101+B0034+NheI+B0034+PSB1K3] Kr [J23101+B0034+NheI+J61048+PSB1K3] Kr Electrophoresis of digested product: [Pcons+RBS+KpnI-HF]Ar (EP)*3


2014/9/9(二) Cultivation of: Pcons+RBS+SacI PCR product-16 Ar Pcons+RBS+SaII PCR product-17 Ar RBS+BFP+Ter PCR product-16,17,29,30 Ar Digestion of: XhoI+PSB1K3 (EP)

2014/9/10(三) Mini prep of: RBS+BFP+Ter-16 Ar RBS+BFP+Ter-17 Ar RBS+BFP+Ter-29 Ar RBS+BFP+Ter-30 Ar Pcons+RBS+Sac-16 Ar Pcons+RBS+Sal-17 Ar Digestion of: RBS+BFP+Ter-16 Ar(EP) RBS+BFP+Ter-17 Ar(EP) RBS+BFP+Ter-29 Ar(EP) RBS+BFP+Ter-30 Ar(EP) Pcons+RBS+SacI-16 Ar(EP) Pcons+RBS+SalI-17 Ar(EP) Electrophoresis: Well1:Marker Well2:Pcons+RBS+SacI-16 dig(EP) Well3:Pcons+RBS+SalI-17 dig(EP) Well4:RBS+BFP+Ter-16 dig(EP) Well5:RBS+BFP+Ter-17 dig(EP) Well6:RBS+BFP+Ter-29 dig(EP) Well7:RBS+BFP+Ter-30 dig(EP) Well8:XhoI-7 dig(XP) Kr

2014/9/11(四) Digestion of: Pcons+RBS+PBAN(ES)(8種除了XhoI) RBS+BFP+Ter(XP) Ligation of: Pcons+RBS+XhoI-7 Ar Cultivation of: Pcons+RBS+AseI-7 Ar Pcons+RBS+SacI-16 Ar Pcons+RBS+SalI-17 Ar Pcons+RBS+NcoI-2 Ar Pcons+RBS+NdeI-2 Ar RBS+BFP+Ter-2 Ar RBS+BFP+Ter-2 Ar SalI-3 Kr Ligation of: Pcons+RBS+XhoI-7 Ar DNA sequencing of: Pcons+RBS+SaeI Ar 8ul VF2 Pcons+RBS+SalI Ar 8ul VF2 RBS+BFP+Ter-29 Ar 8ul VF2 + 8ul VR RBS+BFP+Ter-30 Ar 5ul VF2 + 5ul VR Digestion of: Pcons+RBS+HindIII dig(EP) Pcons+RBS+NheI dig(EP) Pcons+RBS+NcoI dig(EP)-->9/11養的mini Pcons+RBS+NdeI dig(EP) Pcons+RBS+SacI dig(EP) Pcons+RBS+SalI dig(EP) Pcons+RBS+AseI dig(EP) Pcons+RBS+KpnI dig(EP) Ligation of: Pcons+RBS+BFP+Ter-30 Kr

2014/9/12(五) Transformation of: Pcons+RBS+NheI+RBS+BFP+Ter Kr Pcons+RBS+NdeI+RBS+BFP+Ter Kr Pcons+RBS+HindIII+RBS+BFP+Ter Kr Pcons+RBS+KpnI-HF+RBS+BFP+Ter Kr Pcons+RBS+AseI+RBS+BFP+Ter Kr Pcons+RBS+SacI+RBS+BFP+Ter Kr Pcons+RBS+NcoI+RBS+BFP+Ter Kr Pcons+RBS+SalI+RBS+BFP+Ter Kr Pcons+RBS+BFP+Ter Kr Pcons+RBS+XhoI Ar Electrophoresis: Well1:Marker Well2:Pcons+RBS+NdeI dig(EP) Cr Well3:Pcons+RBS+NcoI dig(EP) Cr Well4:Pcons+RBS+SacI dig(EP) Ar Well5:Pcons+RBS+SalI dig(EP) Ar Well6:Pcons+RBS+AseI dig(EP) Ar Well7:Pcons+RBS+HindIII dig(EP) Ar Well8:Pcons+RBS+NheI dig(EP) Ar Well9:Pcons+RBS+KpnI dig(EP) Ar

2014/9/13(六) Ligation of: Pcons+RBS+AseI Kr Pcons+RBS+NdeI Kr Pcons+RBS+SalI Kr Pcons+RBS+SacI Kr PCR of: Pcons+RBS+HindIII+RBS+BFP+Ter Kr x8 Pcons+RBS+NheI+RBS+BFP+Ter Kr x8 Pcons+RBS+NdeI+RBS+BFP+Ter Kr x8 Pcons+RBS+NcoI+RBS+BFP+Ter Kr x8 Pcons+RBS+KpnI-HF+RBS+BFP+Ter Kr x8 Pcons+RBS+AseI+RBS+BFP+Ter Kr x8 Pcons+RBS+Xhol Kr x8 Pcons+RBS+SalI+RBS+BFP+Ter Kr x16 Pcons+RBS+SacI+RBS+BFP+Ter Kr x16 Electrophoresis: Gel 1 Pcons+RBS+SalI+RBS+BFP+Ter Kr x16 Gel 2 Pcons+RBS+SacI+RBS+BFP+Ter Kr x16 Gel 3 Pcons+RBS+HindIII+RBS+BFP+Ter Kr x8 Pcons+RBS+NheI+RBS+BFP+Ter Kr x8 Gel 4 Pcons+RBS+NdeI+RBS+BFP+Ter Kr x8 Pcons+RBS+NcoI+RBS+BFP+Ter Kr x8 Gel 5 Pcons+RBS+KpnI-HF+RBS+BFP+Ter Kr x8 Pcons+RBS+AseI+RBS+BFP+Ter Kr x8 Gel 6 Pcons+RBS+Xhol Kr x8 psb1K3 dig(EP)


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