Team:TU Delft-Leiden/Templates/tocmodnonfloat

From 2014.igem.org

(Difference between revisions)
 
(20 intermediate revisions not shown)
Line 1: Line 1:
<html>
<html>
 +
<body>
 +
<div class="tableofcontents">
<div class="tableofcontents">
-
<center> <h3> Contents </h3> </center>
+
 
 +
<center> <h3> Contents </h3> </center>
<ul>
<ul>
-
<li><a href="/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling"><p>Overview</p>
+
   
-
        </a>
+
    <li>
-
</li>
+
          <a href="/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling">
-
<li><a href="/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling/Techniques"><p>Modeling Techniques</p>
+
          <p>Modeling Overview</p>
-
        </a>
+
          </a>
-
<ul>
+
    </li>
-
<li> <a href="/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling/Techniques/Deterministic"><p>Deterministic Modeling Theory</p>
+
-
        </a></li>
+
-
<li> <a href="/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling/Techniques/FBA"><p>Flux Balance Analysis Theory</p>
+
-
        </a>
+
-
</li>
+
-
<li> <a href="/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling/Techniques/Percolation"><p>Percolation and Graph Theory</p>
+
-
        </a>
+
-
</li>
+
-
</ul>
+
-
</li>
+
-
<li><a href="/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling/Landmine"><p>Landmine Module</p>
+
    <li>
 +
         
 +
          <a href="/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling/Landmine">
 +
          <p>Landmine Module</p>
 +
          </a>
 +
         
 +
          <ul>
 +
 
 +
              <li>
 +
                    <a href="https://2014.igem.org/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling/Landmine#simplemodel">
 +
                    <p>Simple Binding Model </p>
 +
                    </a>
 +
              </li>
 +
              <li>
 +
                    <a href="https://2014.igem.org/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling/Landmine#coopbinding">
 +
                    <p>Cooperative Binding Model</p>
 +
                    </a>
 +
              </li>
 +
 
 +
          </ul>
 +
    </li>
 +
 +
    <li>
 +
 
 +
          <a href="/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling/EET">
 +
          <p>EET Module</p>
 +
          </a>
 +
 +
          <ul>
 +
 
 +
              <li>
 +
                 
 +
                    <a href="/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling/EET/FBA">
 +
                    <p> Flux Balance Analysis of the EET Module</p>
 +
                    </a>
 +
 
 +
                    <ul>
 +
                        <li>
 +
                        <a href="https://2014.igem.org/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling/EET/FBA#EETCoreModel">
 +
                        <p>Extracellular Electron Transport in the <i>E. Coli Core</i> Model </p>
 +
                        </a>
 +
                        </li>
 +
                        <li>
 +
                        <a href="https://2014.igem.org/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling/EET/FBA#RobustnessAnalysis">
 +
                        <p>Robustness Analysis of the EET Pathway </p>
 +
                        </a>
 +
                        </li>
 +
                        <li>
 +
                        <a href="https://2014.igem.org/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling/EET/FBA#PhenotypicPhasePlanes">
 +
                        <p>Phenotypic Phase Planes of the EET Pathway </p>
 +
                        </a>
 +
                        </li>
 +
                        <li>
 +
                        <a href="https://2014.igem.org/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling/EET/FBA#FluxVariabilityAnalysis">
 +
                        <p>Flux Variability Analysis</p>
 +
                        </a>
 +
                        </li>
 +
                        <li>
 +
                        <a href="https://2014.igem.org/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling/EET/FBA#EETExtendedModel">
 +
                        <p>Extracellular Electron Transport in the <i>iJO1366</i> Model</p>
 +
                        </a>
 +
                        </li>
 +
                        <li>
 +
                        <a href="https://2014.igem.org/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling/EET/FBA#Conclusions">
 +
                        <p>Conclusions</p>
 +
                        </a> 
 +
                        </li>
 +
                    </ul>
 +
              </li>
 +
 
 +
              <li>
 +
 
 +
                    <a href="/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling/EET/Deterministic">
 +
                    <p> Deterministic Model of EET Complex Assembly</p>
 +
                    </a>
 +
 
 +
                    <ul>
 +
                        <li>
 +
                        <a href="https://2014.igem.org/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling/EET/Deterministic#extensive">
 +
                        <p>Extensive Model of EET Complex Assembly</p>
 +
                        </a>
 +
                        </li>
 +
                        <li>
 +
                        <a href="https://2014.igem.org/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling/EET/Deterministic#simplified">
 +
                        <p>Simplified Model of EET Complex Assembly</p>
 +
                        </a>
 +
                        </li>
 +
                    </ul>
 +
   
 +
              </li>
 +
 
 +
        </ul>
 +
  </li>
 +
 
 +
  <li>
 +
       
 +
        <a href="/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling/Curli">
 +
        <p>Curli Module</p>
         </a>
         </a>
-
<ul>
+
              <ul>
-
<li> <a href="https://2014.igem.org/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling/Landmine#simplemodel"><p>Simple Binding Model </p></a>   </li>
+
                    <li>
-
<li> <a href="https://2014.igem.org/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling/Landmine#coopbinding"><p>Cooperative Binding Model</p></a>   </li>
+
 
-
</ul>
+
                    <a href="/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling/Curli#Gene Level">
-
</li>
+
                    <p>Gene Level Modeling</p>
-
<li><a href="/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling/EET"><p>EET Module</p>
+
                    </a>
-
        </a>
+
                          <ul>
-
<ul>
+
                              <li>
-
<li> <a href="/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling/EET/Deterministic"><p> Deterministic Model of the EET Module</p>
+
                              <a href="https://2014.igem.org/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling/Curli#extendedgenelevel">
-
        </a>
+
                              <p>Extensive Gene Level Modeling</p>
-
</li>
+
                              </a>
-
<li> <a href="/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling/EET/FBA"><p> Flux Balance Analysis of the EET Module</p>
+
                              </li>
-
        </a>
+
 
-
<ul>
+
                              <li>
-
<li> <a href="https://2014.igem.org/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling/EET/FBA#ExtracellularElectronTransportCoreModel"><p>Extracellular Electron Transport in the <i> E. Coli </i> Core Model </p></a>   </li>
+
                              <a href="https://2014.igem.org/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling/Curli#simplifiedgenelevel">
-
<li> <a href="https://2014.igem.org/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling/EET/FBA#RobustnessAnalysis"><p>Robustness Analysis of the EET Pathway </p></a>   </li>
+
                              <p>Simplified Gene Level Modeling</p>
-
<li> <a href="https://2014.igem.org/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling/EET/FBA#PhenotypicPhasePlanes"><p>Phenotypic Phase Planes of the EET Pathway </p></a>   </li>
+
                              </a>
-
<li> <a href="https://2014.igem.org/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling/EET/FBA#FluxVariabilityAnalysis"><p>Flux Variability Analysis</p></a>  </li>
+
                              </li>
-
<li> <a href="https://2014.igem.org/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling/EET/FBA#ExtracellularElectronTransportExtendedModel"><p>Extracellular Electron Transport in the iJO1366 Model</p></a>   </li>
+
                          </ul>
-
<li> <a href="https://2014.igem.org/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling/EET/FBA#Conclusions"><p>Conclusions</p></a>   </li>
+
                    </li>
-
</ul>
+
 
-
</li>
+
                    <li>
-
</ul>
+
                    <a href="/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling/Curli#Cell Level">
-
</li>
+
                    <p>Cell Level Modeling</p>
-
<li><a href="/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling/Curli"><p>Curli Module</p>
+
                    </a>
-
        </a>
+
                          <ul>
-
</li>
+
                              <li>
 +
                              <a href="https://2014.igem.org/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling/Curli#discretization">
 +
                              <p>Discretization of Gene Level Model</p>
 +
                              </a>
 +
                              </li>
 +
           
 +
                              <li>
 +
                              <a href="https://2014.igem.org/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling/Curli#building">
 +
                              <p>Building the Curli Fibrils</p>
 +
                              </a>
 +
                              </li>
 +
 
 +
                              <li>
 +
                              <a href="https://2014.igem.org/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling/Curli#conductiveradius">
 +
                              <p>Conductive Radius of the Cell</p>
 +
                              </a>
 +
                              </li>
 +
                          </ul>
 +
                    </li>
 +
 
 +
                    <li>
 +
                    <a href="/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling/Curli#Colony Level">
 +
                    <p>Colony Level Modeling</p>
 +
                    </a>
 +
                          <ul>
 +
                              <li>
 +
                              <a href="https://2014.igem.org/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling/Curli#percolation">
 +
                              <p>Percolation</p>
 +
                              </a>
 +
                              </li>
 +
 
 +
                              <li>
 +
                              <a href="https://2014.igem.org/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling/Curli#resistivity">
 +
                              <p>Resistivity</p>
 +
                              </a>
 +
                              </li>
 +
                          </ul>
 +
                    </li>
 +
              </ul>
 +
    
 +
  </li>
 +
 
 +
  <li>
 +
 
 +
          <a href="/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling/Techniques">
 +
          <p>Modeling Methods</p>
 +
          </a>
 +
   
 +
          <ul>
 +
             
 +
              <li>
 +
                    <a href="/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling/Techniques#DeterministicTheory">
 +
                    <p>Deterministic Modeling Methods</p>
 +
                    </a>
 +
              </li>
 +
              <li>
 +
                    <a href="/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling/Techniques#FBATheory">
 +
                    <p>Flux Balance Analysis Method</p>
 +
                    </a>  
 +
              </li>
 +
              <li>
 +
                    <a href="/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling/Techniques#PercolationTheory">
 +
                    <p>Percolation Theory</p>
 +
                    </a>
 +
              </li>
 +
              <li>
 +
                    <a href="/Team:TU_Delft-Leiden/Modeling/Techniques#GraphTheory">
 +
                    <p>Graph Theory</p>
 +
                    </a>
 +
              </li>
 +
 
 +
          </ul>   
 +
 
 +
    </li>
 +
 
</ul>   
</ul>   
</div>
</div>
 +
</body>
</html>
</html>

Latest revision as of 20:02, 9 October 2014